Giovanni Maria Pavarin è nato a Rovigo nel 1955.

Magistrato dal 1985, ha svolto funzioni di Pretore penale, civile e del lavoro a Rovigo. Dal 1997 al 2010 ha svolto le funzioni di magistrato di sorveglianza di Padova. Dal 3.11.2010 è stato Presidente del Tribunale di Sorveglianza di Venezia. Attualmente è Presidente del Tribunale di Sorveglianza di Trieste.

Ha prestato attività di collaborazione presso le cattedre di diritto civile delle Università degli Studi di Ferrara e di Verona.

È coautore di varie pubblicazioni in materia civile e penale. Oggi è professore a contratto di diritto penale nella Scuola di specializzazione per le Professioni legali costituita dalle Facoltà di giurisprudenza di Ferrara, Padova e Trieste e dalla Facoltà di Economia Ca' Foscari di Venezia.